Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms