Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rrp12Q6P5B0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms