Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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