Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca2Q6DIC0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca2Q6DIC0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms