Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nop58Q6DFW4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nop58Q6DFW4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms