Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pram1Q6BCL1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms