Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp4Q68FH0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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