Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Sdc3Q64519 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Sdc3Q64519 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sdc3Q64519 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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