Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim24Q64127 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms