Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift52Q62559 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ift52Q62559 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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