Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ndufa4Q62425 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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