Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpd52Q62393 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms