Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms