Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim25Q61510 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim25Q61510 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim25Q61510 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim25Q61510 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim25Q61510 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim25Q61510 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms