Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms