Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nell2Q61220 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nell2Q61220 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nell2Q61220 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nell2Q61220 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nell2Q61220 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nell2Q61220 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nell2Q61220 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms