Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms