Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
JrkQ60976 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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JrkQ60976 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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JrkQ60976 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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JrkQ60976 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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JrkQ60976 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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JrkQ60976 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms