Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rbbp4Q60972 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms