Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Traf3Q60803 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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