Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Stxbp3Q60770 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp3Q60770 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp3Q60770 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp3Q60770 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms