Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mkrn3Q60764 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms