Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms