Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Slc5a6Q5U4D8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms