Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim38Q5SZ99 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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