Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms