Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TefmQ5SSK3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TefmQ5SSK3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TefmQ5SSK3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TefmQ5SSK3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TefmQ5SSK3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms