Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85aQ5SP85 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85aQ5SP85 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms