Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bhlha9Q5RJB0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms