Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Trappc1Q5NCF2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Trappc1Q5NCF2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Trappc1Q5NCF2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Trappc1Q5NCF2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc1Q5NCF2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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