Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim41Q5NCC3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim41Q5NCC3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms