Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ecm2Q5FW85 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ecm2Q5FW85 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ecm2Q5FW85 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ecm2Q5FW85 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms