Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx25Q3ZT31 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx25Q3ZT31 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx25Q3ZT31 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Snx25Q3ZT31 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx25Q3ZT31 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms