Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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