Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Lrrc43Q3V0L5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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Lrrc43Q3V0L5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Lrrc43Q3V0L5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Lrrc43Q3V0L5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Lrrc43Q3V0L5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc43Q3V0L5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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