Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Usp48Q3V0C5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp48Q3V0C5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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