Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capn13Q3UW68 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Capn13Q3UW68 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capn13Q3UW68 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms