Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms