Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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