Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms