Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skap2Q3UND0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skap2Q3UND0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms