Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hdgfl2Q3UMU9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms