Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upf3aQ3ULJ3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upf3aQ3ULJ3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upf3aQ3ULJ3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upf3aQ3ULJ3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upf3aQ3ULJ3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upf3aQ3ULJ3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upf3aQ3ULJ3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upf3aQ3ULJ3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Upf3aQ3ULJ3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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