Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms