Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf224Q3UIW8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms