Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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