Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms