Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc9Q3U0M1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms