Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hbq1bQ3U0A6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Hbq1bQ3U0A6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hbq1bQ3U0A6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hbq1bQ3U0A6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms