Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctdnep1Q3TP92 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdnep1Q3TP92 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms